今度はティラノイドの本拠地を襲撃することに。
ラチェットは例によって例のごとく作戦のほとんどを担うことになり、レンジャー隊とともにパワージェネレーターの破壊に向かう。
レンジャー隊とともにパワージェネレーターを破壊した後、施設の外に出て４基のキャノン砲台を破壊する。
それが済めばボス戦だ。敵の数も多く、まさに序盤の山場といえるだろう。
また、レンジャー隊とのフリーミッションもある。武器の強化などに役立てよう。
レンジャー隊とともにスカイダイビングで基地に侵入
ここからスカイダイビング時に追尾ミサイルが登場。当然そのまま落ちていると食らってしまうので、
常に移動しながら落ちることを心がけよう。円を描くようにして移動すると当たりにくい。
ショップに武器ガラメカ：ランペイジャー（１６００００ボルト）が入荷
着陸したら早速ティラノイド達がお出迎えだ。ガラメカで応戦しよう。
ここまで来ればある程度武器ガラメカが揃っているはず。
基本的にどのガラメカを使っても進めるが、スナイパーライフルはよろしくない。
あとで使う機会があるのでそこで使おう。
ジェネレーターの部屋にはバリヤーが張られている。まずバリヤー発生装置を破壊しよう。
そのあとジェネレーターを破壊して出口に向かえばひとまず終了だ。
イベント後、施設の外に出る（コンティニューポイント）
４基のプラズマ砲台を破壊する（レーダーで緑丸で表示されているもの）
すべて破壊すると基地内に入れるようになる（基地内侵入でコンティニューポイント）
なんとも気味の悪い視点切り替えから始まるボス戦。とにかくデカイ。
近づいてきてのぶん殴りと遠距離からの飛び道具で近・遠の攻撃が揃っているので、
適度な距離を保ちつつ攻撃するのが得策。
基本的に地上にいるときはぶん殴りをしてくる。
ラチェットとの距離が遠いとダッシュで距離を一気に詰めてくるので、
ある程度離れるぐらいにして、曲がり角まで来たら誘導してわざと攻撃させ、角を曲がって
回避すると避けやすい。
また、ラチェットから離れ天井にぶら下がると、今度はエネルギー弾を連射して攻撃してくる。
横平面を一通り撃つため、タイミングよくジャンプで避ければ当たらない。
ある程度体力を減らすと、視点が切り替わり（ボスの視点になる）、
マザーの攻撃を避けつつ次の部屋へ向かうことになる。
ミサイルは常に先に進んでいればほとんど当たらない。ザコにはあまり構わないでおこう。
ザコは大体ミサイルの爆風に巻き込まれて倒れてしまう。
次の部屋まで移動すると、再びさっきと同じようなバトルに。
ただし今度はエネルギー弾の発射口が２つになり、それとは別にミサイルも使う。
エネルギー弾はさっきと同じようにして避けれるが、ミサイルが厄介。
爆風があるので移動しながらジャンプしたりして工夫しないと食らってしまう。
部屋移動はもうないので一気にカタを付けよう。
マザーを倒すとイベント
ショップに武器ガラメカ：ホロングラブ（３００００ボルト）が入荷
レンジャー隊とのバトルミッション：アイランドストライク
| ミッション名 | 報酬（初回） | 説明 | その他 |
| カヴーじまアサルト | ８０００ボルト | カヴーじまの レンジャーきちが ティラノイドのもうれつな こうげきにさらされている！ てきをげきたいし、きしゅう ぶたいとともに、しまの ちゅうしんにある ホバーシップ はっちゃくじょうを せんりょうせよ！ |
ホバーシップ周辺の敵を全滅させればクリアとなる スカイダイビングあり（追尾ミサイルも当然飛んでくる） |
| カヴーじまドッグファイト | １２０００ボルト | ティラノイドたちは せんとうきぶたいをしまに おくりこんだ！てにいれた ホバーシップにのりこみ、 くうちゅうでドッグファイト！ |
円盤は倒す必要はない 輸送シップをすべて破壊すればクリアとなる |
| サンダーボルトだいさくせん | １６０００ボルト | カヴーじまの ティラノイドきちは バリヤーでおおわれている。 レンジャーたいがその バリヤーをはかいしている あいだに、ホバーシップで そらからえんごせよ！ |
シップを含む敵を全滅させればＯＫ |
| ファイナルバトル | ２００００ボルト | レンジャーたいは、 ティラノイドきちをかこむ シールドをとめることに せいこう！レンジャーたいと ともにきちに しんにゅうして、すべての ティラノイドをたおせ！ |
基地の上にいるティラウォーカーは手前の橋からスナイパーライフルで撃つといい |
